O jogador, natural de São Paulo, foi revelado nas categorias de base do São Paulo e teve sua estreia como profissional em 2012 pelo clube tricolor. Após cinco temporadas atuando no Morumbi, João Schmidt se transferiu para a Atalanta, da Itália, em 2017. Além disso, o volante teve passagens por equipes portuguesas, como Vitória de Setúbal e Rio Ave, antes de se aventurar no futebol japonês, onde jogou por dois anos no Nagoya Grampus e passou as três últimas temporadas defendendo as cores do Kawasaki Frontale. Em 2024, o jogador atuou em 44 partidas pela equipe japonesa e anotou um gol.
A contratação de João Schmidt se soma a outros reforços já anunciados pelo Santos, como os meias Giuliano e Otero, os laterais-direitos Aderlan e Hayner, o lateral-esquerdo Jorge, o zagueiro Gil, e o atacante Willian Bigode. Além dos novos reforços, o clube também renovou o contrato de jogadores que já estavam no elenco, como o goleiro João Paulo, o volante Rincón e o atacante Julio Furch. Todos concordaram em reduzir seus salários devido à situação financeira do clube, que terá um orçamento menor em 2024 por não disputar a Série A do Campeonato Brasileiro.
Além disso, o Santos confirmou a permanência dos zagueiros Joaquim e Jair no elenco. Com a participação apenas no Campeonato Paulista e na Série B em 2024, o clube segue em negociações para possíveis novos reforços, inclusive com o atacante Guilherme, do Grêmio.
Com a chegada do volante João Schmidt e o planejamento para os próximos desafios, o Santos busca se reestruturar e fortalecer o elenco para a temporada que se aproxima.